본 발명은 된장에서 분리한 단백질 분해능 및 항균 활성이 우수한 신규 바실러스 벨레젠시스 KD1 균주에 관한 것으로, 단백질 분해능 및 항균활성이 우수하므로, 간장 및 된장 등 발효식품의 제조 과정에서 식품 위해 미생물의 발생 및 생장을 억제할 수 있으므로, 안전한 발효식품의 제조에 유용하게 활용할 수 있다.